הטיפול באמצעות גירוי מוחי עמוק היה מיועד במשך שנים רבות לחולי פרקינסון, רעד ראשוני, ודיסטוניה. כיום, אפשרות זו פתוחה גם בפני חולים עם אפילפסיה מוקדית אשר הושתלו בעבר עם קוצב וגאלי (VNS) ועדיין סובלים מהתקפים.
הטיפול עושה שימוש בקוצב מוחי, הכולל אלקטרודה המושתלת במוח בעובי של כ- 1 מ"מ, וקוצב אשר מושתל בחזה מתחת לעור ומחובר לאלקטרודות המוחיות, מתחת לעור. האלקטרודות המוחיות מושתלות דרך חורים קטנים בגולגולת (כ- 1.5 ס"מ קוטר). הפרוצדורה נעשית בהרדמה.
באפילפסיה, הגירוי המוחי המתמשך גורם לירידה של כ- 75% בתדירות ההתקפים ויעילותו הולכת ועולה בשנים הראשונות. טכנולוגיה זו קיימת למעלה מ 20 שנה ונמצאת בשימוש נרחב כטיפול בהפרעות תנועה כגון פרקינסון, רעד ראשוני, ועוד. בשנים האחרונות היא מאושרת בארץ וברחבי העולם גם לשימוש באפילפסיה, לאור ההצלחה הניכרת בשליטה בהתקפים והבטיחות הרבה של הטיפול, כפי שתועד במחקרים בינלאומיים רבי משתתפים, אשר בדקו את השפעת הקוצב לאורך שנים.
טרם הניתוח יש צורך בבדיקת MRI מוח והערכת נוירולוג ונוירוכירורג מומחים באפילפסיה. במידה ונמצא מתאים לניתוח, המטופל מוזמן לאשפוז. משך האשפוז הוא לרוב כ- 3 ימים. לאחר הניתוח הקוצב מופעל.
לרב נדרשים ביקורי מרפאה אחת ל- 3-6 חודשים לוודא את תקינות המכשיר ואת יעילות הטיפול, ולהתאמת הטיפול התרופתי בהתאם למידת השליטה בהתקפים.
האלקטרודה נשארת במוח לכל המשך החיים בלי צורך להחליפה והשיפור בתדירות ההתקפים הינו ארוך טווח. סוללת הקוצב, אשר פועל באופן רציף 24 שעות ביממה, מושתלת מתחת לעור בחזה ויש צורך להחליפה אחת ל- 5-10 שנים. החלפת הסוללה הינה פרוצדורה קצרה, תת עורית בלבד בחזה, ונעשית בהרדמה מקומית תחת טשטוש, במסגרת אשפוז יום.